Des résultats « anormaux » du séquençage de l’ADN ont conduit à cette découverte unique en son genre.

Une équipe de recherche d’universités américaines a observé pour la première fois qu’un virus s’attachait à un autre. Cette découverte, la première du genre, est survenue après qu’un laboratoire a signalé qu’un échantillon d’ADN d’un virus, que le groupe de recherche de l’Université du Maryland, comté de Baltimore (UMBC) a envoyé pour séquençage, était contaminé par du matériel génétique d’un autre virus étranger.

Contamination ou coup de chance ?

En cas de doute, le chef du groupe UMBC, Ivan Erill, a envoyé un autre échantillon à séquencer, mais a obtenu des résultats identiques. La séquence qu’ils espéraient obtenir correspondait à un bactériophage ou virus phagique (qui infecte les cellules bactériennes). Cependant, « au lieu de simplement trouver cela, nous avons également trouvé une petite séquence, qui ne correspondait à rien de ce que nous connaissions », explique Erill.

Des analyses bioinformatiques ultérieures ont révélé qu’ils étaient en présence d’un virus satellite et de son virus auxiliaire. Les virus satellites dépendent non seulement de leur organisme hôte pour compléter leur cycle de développement, mais ils ont également besoin d’un autre virus, l’aide, explique Erill. Le virus satellite a besoin de l’aide de l’autre pour construire son enveloppe protectrice ou pour l’aider à multiplier son ADN. Ces relations virales nécessitent que le satellite et l’assistant soient proches l’un de l’autre.

L’indice de l’absence d’un gène clé

La plupart des virus satellites contiennent un gène qui leur permet de s’intégrer dans le matériel génétique de la cellule hôte après y avoir pénétré. Ce gène permet au satellite de se reproduire chaque fois que le virus auxiliaire pénètre dans la cellule. Cependant, le virus satellite UMBC, appelé MiniFlayer, est le premier cas connu d’un satellite sans gène d’intégration. « Ce satellite a réglé et optimisé son génome pour l’associer à l’assistant depuis, je dirais, au moins 100 millions d’années », a déclaré Erill.

Images TEM représentatives de (A) MulchRoom ; ( Oui ) Flagelleur mental ; (C) Mini-couche ; (D) MiniFlayer adsorbé sur le cou de MindFlayer ; (MI) Protéines du cou du MindFlayer montrant des fibres résiduelles de la queue du MiniFlayer ; ( F ) MindFlayer/MiniFlayer adsorbé. deCarvalho et al., 2023

Parce que le MiniFlayer ne peut pas s’intégrer dans l’ADN de la cellule hôte, il doit être au moins temporairement proche de son assistant, appelé MindFlayer, chaque fois qu’il entre dans une cellule hôte, s’il veut se multiplier. Avec ces indices, l’équipe a supposé un scénario jamais vu auparavant dans lequel le satellite devrait être connecté à un assistant dans une relation à long terme. Parce que « sinon, comment allez-vous vous assurer que vous allez entrer dans la cellule en même temps ? »

Des visuels étonnants

Avec ces soupçons, l’équipe a appelé Tagide deCarvalho de l’UMBC pour obtenir une image de ce qui se passait avec le microscope électronique à transmission (MET). « Ce n’est pas tout le monde qui a un GDT à sa disposition », explique M. deCarvalho. La plupart des phages sont constitués d’une « tête » avec de l’ADN, d’un « cou » de longueur variable et d’une « queue » à travers laquelle ils injectent ce matériel génétique dans la cellule hôte.

Dans les images détaillées, il a été observé que 80 % des virus auxiliaires avaient un virus satellite attaché au « cou » du virus. « Quand je l’ai vu, je me suis dit : « Je n’arrive pas à y croire » », dit deCarvalho. « Personne n’a jamais vu un bactériophage, ou tout autre virus, attaché à un autre virus », a-t-il ajouté. Les résultats sont décrits dans une publication publiée mardi dans le Journal of the International Society of Microbial Ecology.

« Il est possible que bon nombre des bactériophages que les gens pensaient contaminés étaient en fait ces systèmes d’aide par satellite », explique deCarvalho. « Alors maintenant, avec ce document, les gens pourraient être en mesure de reconnaître davantage de ces systèmes », a-t-il déclaré.

Publié le 3 Novembre 2023 sur actualidad.rt.com

Hashtag Libractus :  
#Biologie #Science #Découvertes #ÉtatsUnis #USA #Experts #Génétique #Technologie #Nature #UMBC #UniversitéDuMaryland #RussiaToday #RT
Hashtag Freedomm :